A Biblioteca Central de Estudos Africanos foi constituída após um esforço conjunto de quatro centros de investigação na área dos estudos africanos: o Centro de Estudos Africanos do ISCTE, o Centro de Estudos Africanos da Universidade do Porto, o Centro de Estudos sobre África e do Desenvolvimento do ISEG/UTL, e o Centro de Estudos Africanos da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa.